Здравствуйте! Вы не обязаны оплачивать налог с продажи своей доли. А вот Ваш брат да, обязан уплатить налог с продажи своей 1/4 доли, уменьшив доход от продажи своей доли в квартире на сумму документально подтвержденных расходов наследодателя на приобретение этой квартиры или на стандартный вычет 250 000 р.

Объясню, на основании чего возникает налог с продажи:
Для квартиры, полученной по наследству, минимальный срок владения с целью освобождения доходов от его продажи от налогообложения составляет три года (п. 17.1 ст. 217, п. п. 2, 3 ст. 217.1 НК РФ). При этом отсчет срока владения идет со дня смерти наследодателя независимо от даты вступления в наследство (п. 2 ст. 218, ст. ст. 1114, 1152 Гражданского кодекса РФ). В случае Вашего брата срок составляет менее 3-х лет.

Как уменьшить налог с продажи доли?
Согласно пункту 2 статьи 220 Налогового кодекса, у брата есть два способа:
- Фиксированный вычет. Вы можете уменьшить полученную сумму не более 1 000 000 рублей (это стандартный имущественный вычет, предусмотренный подпунктом 1 пункта 2 статьи 220 НК РФ). Если одним договором продаете, то вычет 250 000р, если брат продаст долю отдельным договором, то вычет 1000 000 р.
- Учёт расходов наследодателя. Вместо фиксированного вычета можно вычесть из своего дохода те деньги, которые когда-то потратил на покупку этой квартиры наследодатель. Главное, чтобы эти траты были подтверждены документально (договоры, чеки, расписки).

Как отчитаться перед налоговой:
1. После продажи квартиры брату нужно сдать в налоговую декларацию 3-НДФЛ и приложить документы, подтверждающие расходы на приобретение отцом своей доли квартиры, или заявить имущественный налоговый вычет.
2. Для подтверждения права на вычет к налоговой декларации приложите:
- копию договора купли-продажи;
- документы, подтверждающие понесенные расходы в связи с приобретением объекта (в случае, если брат вместо применения вычета хочет уменьшить облагаемый доход на сумму расходов).

Оплачивать налог нужно не позднее 15 июля года, в котором надлежит представить налоговую декларацию. Уплата налога осуществляется в качестве единого налогового платежа (п. 1 ст. 11.3, п. 1 ст. 58, п. 4 ст. 228 НК РФ).

Нюансы:
Если брат уменьшает налоговую базу на сумму расходов наследодателя, то неважно, сколько лет назад наследодатель приобрел квартиру - давность значения не имеет.
И даже несмотря на то что наследодатель, возможно, получал вычет, наследник все равно вправе опираться на его расходы при продаже унаследованного жилья. То есть если наследодатель когда-то вернул себе налог с покупки, это никак не мешает наследнику использовать ту же сумму покупки для уменьшения своего налога при продаже. Минфин и ФНС подтверждают: наследник может уменьшить доход на расходы наследодателя, даже если последний получал имущественные вычеты, предусмотренные подпунктами 3 и 4 пункта 1 статьи 220 НК РФ.

Таким образом, доход от продажи квартиры, находившейся в собственности наследника менее трех лет с даты смерти наследодателя, подлежит обложению НДФЛ.