Екатерина, добрый день. Если дом введён в эксплуатацию, поставлен на кадастровый учёт, право собственности застройщика (или иного лица) зарегистрировано, то продажа осуществляется именно по договору купли-продажи. Застройщик или любое иное лицо вправе решать в каком виде продавать квартиру: с отделкой или без. Отделка подъездов, коммуникации, лифты и пр., что находится за пределами квартиры должны быть завершены. Но я лично встречал долгострои, которые в конце-концов сдавались. При это даже спустя долгое время, проводились работы по завершению отделки подъездов. О качестве там конечно говорить не стоит. Вывод: купить можно, но в договоре стоит чётко прописывать сроки передачи квартиры после регистрации перехода права собственности; что квартира продаётся с отделкой (но отделка - понятие растяжимое); то, что будет указан срок передачи квартиры, тоже не гарантия, т.к. продавец-застройщик может тянуть с подачей документов на регистрацию. Да и захотите ли Вы потом судиться, в случае каких-либо нарушений?

"Но как могла принять дом госкомиссия, если он еще недостроен?"- на форуме ответ на этот вопрос не получите.
"Какие риски?" - риски подписания акта передачи с задержкой. Отделку тоже могут не закончить в срок.
Договор купли- продажи с застройщиком заключать можно, нужно только проверки по юридическому лицу сделать.