Здесь только договариваться.
Вы пишите, что речь идёт о квартирах, а значит идеального соотношения долей и количества метров, невозможно. Никакой суд, ни Ставропольский ни Верховный ни Страсбургский, не понудят другого собственника/ов, как Вы выразились)))) "перенести" доли туда-сюда.
Если бы речь шла о частном домовладении с отдельными помещениями и фактическими разными входами, то это было бы реально. И то, вопрос бы не стоял о "перенести" доли, а лишь о выделении бы долей в самостоятельные объекты.
У вас обычные сложные взаимоотношения между сособственниками, ничего нового..... Нанимайте переговорщика, который сверху ситуации донесёт второму сособственнику необходимость либо обмена указанных долей, либо совместной продажи обоих объектов и справедливого раздела денег.

Возможно заключить с этим собственником договор мены долей. Исключительно с нотариальным удостоверением. В результате мены у каждого из вас будет в собственности по квартире. В зависимости от равнозначности и равноценности квартир предусмотрите и согласуйте размер доплаты. В любом случае, это должно решаться согласием сторон.
Так же можно продать квартиры целиком и разделить деньги , пропорционально долям. В последствие каждый купит, то , что нужно и по средствам..

А что вы переносить хотите, если и там и там собственник вы? Хотите с другим собственником поменяться долями? Естественно без его согласия не получится, даже в судебном порядке такое заставить сделать нельзя.