ID: 15493724, максимально уменьшить налог на форуме сложно, здесь нужен тщательный подход с учётом, что у Вас детские доли, опека, математика и так далее.

На мой взгляд, никаких сложностей и налогов возникнуть не должно. 4/6 у бывшего супруга налогом не облагается, т.к. это "приращение собственности" (как выше А.Долгов расписал), 2 детские доли по 1/6 налогом тоже не облагается, конечно при условии, что ст-ть всей кв-ры 5 млн, а 1/6 доли, соотв. 833 т.р., при условии, что кадастр.ст-ть кв-ры не более 7.14 млн (70% которой будут равны 5 млн.).
Все доли было бы логично продать одним ДКП, который можно назвать" ДКП долей в квартире", расписав ст-ть каждой доли, при этом налог.вычет в 1 млн. руб. должны иметь право все продавцы. Если принимать это во внимание цитату ФНС от А.Барекян, стоит заключить 3 ДКП - на 4/6, 1/6 и 1/6 доли. Не вижу проблем и в таком оформлении сделки, даже для покупателя, после гос.регистрации он станет соб-ком всей кв-ры, а не отдельных долей.
И конечно, потребуется разрешение Органов опеки и нотар.удостоверение сделки. Новостройку Опека не пропустит.
Налоговый вычет при покупке "альтернативы", на б.супруга и детей - это уже отдельный вопрос.

Вы же хотите минимизировать или вовсе не платить налог. Поэтому в договоре купли продажи, необходимо указать стоимость каждой доли. Стоимость Вашей доли 3 млн., руб. Стоимость долей детей по 1 млн., руб каждая. Если я все правильно понял, налога не будет.
Может Вам стоит подождать, и продать квартиру по истечении 3-х лет. Проблема решится сама собой.

ID: 15493724, сегодня в 19:48 : и что это даст? Ничего это НЕ даст, если кадастровая стоимость не позволит. Вот официальная позиция налоговой:

"В случае если имущество, находившееся в долевой или совместной собственности менее минимального предельного срока владения, было продано как единый объект права собственности по одному договору купли-продажи, имущественный налоговый вычет в размере 1 000 000 рублей распределяется между совладельцами этого имущества пропорционально их доле, либо по договоренности между ними (в случае реализации имущества, находившегося в общей совместной собственности).
Если каждый владелец доли в праве собственности на имущество продал свою долю, находившуюся в его собственности по отдельному договору купли-продажи, то он вправе получить имущественный налоговый вычет также в размере 1 000 000 рублей."

Если 70% от кадастровой стоимости меньше чем пять миллионов по ДКП, то налог за каждого ребёнка составит - 86 666 рублей.
Продать доли отдельными договорами на практике очень сложно, а с детскими долями практически нереально, но если Вам каким-то чудом удастся продать двумя договорами, то не сложно понять, что налог к уплате нужно разделить на два и получить сумму к уплате в размере – 43 333 р.

На двоих детей получается по 1\6 доли на ребенка от стоимости квартиры, при стоимости квартиры в 5 000 000 руб. как правильно производится налоговый вычет в 1 000 000 руб. и какой будет налог на ребенка?

Тогда стоит в договоре купли-продажи квартиры обозначить стоимость каждой доли. Для этого не обязательно продавать отдельными договорами.

ID: 15493724, тот риэлтор говорит правильно, по детям возникает налог, а супруг освобождён от налога.

Риелтор говорит, что в части супруга, налог не платится, а в долях несовершеннолетних детей, налог нужно будет платить, так как изначально они не являлись собственниками и получили выгоду?

Здравствуйте. Совершенно верно, налога в Вашей ситуации не будет. Поскольку согласно ст. 235 ГК РФ изменение состава собственников, в том числе переход имущества к одному из участников общей долевой собственности, не влечет для этого лица прекращения права собственности на указанное имущество. При этом на основании ст. 131 ГК РФ изменение состава собственников имущества предусматривает государственную регистрацию такого изменения.
В связи с этим, моментом возникновения права собственности у участника общей долевой собственности на квартиру, является не дата повторного получения свидетельства о праве собственности на имущество в связи с изменением состава собственников квартиры и размера их долей, а момент первоначальной государственной регистрации права собственности на данную квартиру.
При продаже квартиры Вам будет необходимо получить разрешение Органов Опеки и Попечительства. Также данная сделка подлежит обязательному нотариальному удостоверению.