Если Вы продаете квартиру, доставшуюся по наследству ранее, чем через 3 года с момента смерти наследодателя, то налог в Вашем случае будет (3,1млн - 1млн)*13%.
Если Вы оформите покупаемую квартиру в собственность в этом же году, то сможете частично скомпенсировать налог полагающимся Вам вычетом на покупку.
В любом случае Вам нужно после продажи подать налоговую декларацию.

Это не совсем "должна быть вторичка". Все, что связано с налогом актуально для налогового периода (календарный год). Допустим, продали Вы свою квартиру в июле 2018 и сразу же купили новостройку (право требования). В декабре 2018 застройщик передал Вам квартиру и Вы зарегистрировали на нее право собственности. Право на вычет при покупке у Вас возникло в налоговом периоде 2018 и за весь 2018 год. В таком случае подлежащий уплате налог можно уменьшить на сумму полагающего вычета при покупке. А вот если собственность на новую квартиру у Вас возникнет 01.01.2019, то увы, налог на доход полученный в 2018 году придется платить по полной и без возможности применить соответствующий налоговый вычет при покупке.

Чтобы получить вычет на покупку это должна быть вторичка. Понял, огромное спасибо.

1.7 млн Вы сможете вычесть из налогооблагаемой базы только в том случае, если оформите СОБСТВЕННОСТЬ на покупаемую квартиру в том же году, когда состоится продажа.
Вы же покупаете в строящемся доме? Это - еще не собственность, а только право требования.

Спасибо за ответ.То есть 3,1 млн минус миллион и минус 1.7 млн = 400 000Плачу 13% с 400 000 рублей?