Доброе утро, Сергей. Право на имущественный вычет появляется с момента подписания акта п-п квартиры в новостройке или при переходе права собственности. Если это первая покупка, то право на вычет Вы получили в момент подписания акта п-п. Далее неважно, в этом году продадите или через два. Право на имущественный вычет сохраняется. Вернуть можно 260 000, либо уменьшить сумму возникшего налога с продажи на сумму вычета, но не более 260 000. Кадастровая стоимость (КС) в Вашем случае не будет учитываться, т.к. КС х 0,7 менее 6 000 000. На приобретение Вы затратили 5 400 000 и есть документально подтверждённые расходы. Поэтому эта сумма налогом не облагается. Всё, что свыше неё, облагается по ставке 13%. Т.е.: 6 000 000- 5 400 000 = 600 000 х 13% = 78 000 налог к уплате. Но как мы определили выше, у Вас есть право на имущественный вычет, поэтому применяется следующая формула: 78 000 - 260 000 = - 182 000. Т.о. к уплате у Вас 0, а в будущем при возникновении налога с продажи или иного дохода, например при белой зарплате, Вы сможете воспользоваться оставшимся лимитом в 182 000. После продажи, необходимо будет подать налоговую декларацию. Она подаётся в следующем году, за годом продажи до 30 апреля. В декларации указываете источник дохода (продажа квартиры) и основание для получения имущественного вычета (купленную квартиру).

В декларацию нужно включить всю сумму уплаченных процентов по кредиту (в пределах 3 млн рублей), за весь период по 2019 год -справка об уплаченных процентах берется в банке.

Да, Сергей. Вы всё правильно понимаете по части получения вычета при покупки. Можете заявить свое право прямо сейчас.
Отчитываться по доходам с продажи нужно в 2020 году до 30 апреля, если продажа состоялась в 2019.

Правильно ли я понял, что при подаче декларации за 2019 год я могу заявить о своём праве на налоговый вычет по приобретению этой квартиры и процентов по ипотеке (получил передаточный акт и зарегистрировал право собственности), и, одновременно, о зачёте в эту сумму налога от продажи?

Для оптимизации налогов, Вы имеете право уменьшить доход от продажи своей квартиры на фактически произведённые и документально подтверждённые расходы, связанные приобретением этой квартиры. (6 млн -5,4 млн)х13%
Если не пользовались правом на вычет при покупке квартиры, сейчас самое время это сделать (акт подписан, собственность получена).
Про миллионный вычет можете забыть, так как либо миллион, либо расходы на покупку можно применить. Что-то одно.