Что делать - читать Ваш договор. В частности, относительно обозначенных вопросов. Кто отвечает за квартиру до момента подписания акта передачи и вообще акт подписывался на сделке или предполагается его подписание по факту передачи квартиры?Далее в зависимости от того, что написано в документах. Если ответственность возложена на продавца, то решайте вопрос путём переговоров, а в случае недостижения согласия можете обратиться с соответвующим иском в суд.

Сначала нужно читать пункты вашего договора, а именно - кто несет риски до подписания Акта. Затем, в идеале, продавцу нужно устранить все "неровности" до получения денег.
Тут больше человеческий фактор - какой у вас окажется продавец и насколько вы сами готовы будете общаться. Думаю, врядли у вас прописаны подробно все риски и цены возмещения ущерба.. Тяжелые споры и противлстояния точно не помогут, поэтому, придется договариваться.

Да в вашем договоре этот пункт должен быть. И если залили то есть "ответственный" за причиненный ущерб. А вот кому он будет его возмещать продавцу или покупателю как раз и следует из пункта вашего договора.