Добрый день!
п. 3.4.1 дословно звучит так: "Предельные (минимальные и (или) максимальные) размеры земельных участков, в том числе их площадь, во всех территориальных зонах в городе Москве не устанавливаются."
Значит, или Вам отказали неправомерно и нужно обратиться за защитой Ваших прав (в суд).
Или есть какие-то нюансы, которые указаны дополнительно в уведомлении об отказе.
Не видя картины вцелом, сложно давать комментарии. Прикрепить фото ответа здесь, насколько я понимаю, не возможно, но, может, перепечатаете ответ?
Без подробностей даже предположить что-то сложно.

3.4.1(1). В территориальных зонах с кодами видов разрешенного использования земельных участков и (или) объектов капитального строительства 2.1, 2.2, 13.1, 13.2 предельный размер (максимальная площадь) земельных участков с указанными видами разрешенного использования составляет 10000 кв. м, если иное не установлено настоящими Правилами.

Добрый день.
У меня так недавно было, только вопрос немного другой и не Москва и область. Максимально был уверен в своей правоте, подал точно такое же заявление повторно и о чудо, получил решение в свою пользу. Не знаю как это объяснить, наверно невнимательность исполнителей.