Банк считает,что в Вашей доле есть ее супружеская доля. Выделить супружескую долю можно в любое время,даже сейчас. Вас бы спас брачный договор,заключенный перед разводом,или соглашение о разделе имущества вместо покупки доли. Теперь - только согласие супруги или не очень принципиальный покупатель.

Попробуйте обратиться в суд с требованием признать квартиру Вашей единоличной собственностью. Сейчас для банков она находится в совместной собственности.

"Банки не пропустят, и это правильно. Ищите покупателя, у которого в советниках такой же риэлтер как был у Вас, может и проскочите. Сделка смотрится под расторжение..." полностью согласен.
Начнем с начала.
"мы с бывшей супругой приобрели квартиру с долями 50/50." интересно каким образом.? У Вас был брачный договор? Судя по дальнейшей вашей эпопеи - нет. ст. ст. 33 СК РФ "Законным режимом имущества супругов является режим их совместной собственности. Законный режим имущества супругов действует, если брачным договором не установлено иное." Кроме как брачным договором по 1/2 вы не получите. Если у Вас Данный договор в ППФ- то однозначно у Вас совместная собственность, что бы в нем не написано. Если он (договор от 2012) нотариальный, и нотариус расписал в нем элементы брачного договора по ст 42 СК РФ (ст. 41СК РФ только нотариат), тогда можно предположить возможность появления 1/2 у каждого. Тогда в дальнейшим надо было отталкиваться от этого договора и проблем не было бы.
"августе 2013 года" расторжение брака - имущество делили ? ( как, каким образом, каким документом?)
"сентябре 2013 года, я выкупил долю бывшей супруги с оформление договора купли продажи" . ЭЭЭЭ ? откуда взялась доля супруга, каким документом ? На данный момент доля супруги в денежном эквиваленте не была 1/2, т.к невыплачена ипотека. ( если предположить , что был брачный договор, то проблем не было бы).
Я бы при покупке попросил бы не только согласие супруги, но и еще бы ряд документов, что бы хоть как то легализовать этот "бардак", согласно ГК РФ Статья 180.

Будем рады если сообщите как разрешилась ситуация.

Спасибо всем большое за помощь. Буду отталкиваться от ваших советов!

Банки не пропустят, и это правильно. Ищите покупателя, у которого в советниках такой же риэлтер как был у Вас, может и проскочите. Сделка смотрится под расторжение. Другой раз по разделу имущества обращайтесь к юристу.

Смею предположить, что у покупателя ипотека от Сбербанка.
Можно, конечно, попытаться договориться с бывшей супругой и идете к нотариусу, берете паспорта, документы на квартиру и свидетельства о браке и расторжение брака. Если нет свидетельства о браке, то можете взять справку с ЗАГСа. Хотя, нотариус может и послать просто, бывают такие случаи.
Или можно попытаться самому объяснить банку, что они не правы, этот процесс долгий и мучительный, иногда переубедить невозможно. И в целом, требования ли Банка это или просто прихоти со стороны юриста/риелтора или самого покупателя, просто прикрываясь банком. Попросите контакты менеджера в Банке. Прямого номера андеррайтера или юриста Банка не дают, поэтому все свои комментарии передаете через менеджера.
Вы оформляли по 1/2 доли, а не в совместную, т.е. заранее договорились о разделе доли недвижимости, что не противоречит законодательству в целом. С этого момента Вы имели право распоряжаться своей долей, но при этом не забывая о том, что это общая долевая собственность со всеми вытекающими.
Если Банк думает, что бывшая супруга может опротестовать, то увы, срок исковой давности прошел, тут можете сослаться на п. 1 ст. 25 и п. 7 ст 38 Семейного Кодекса РФ, Но тут они могут попытаться сослаться на п. 19 Постановления №15 Пленума Верховного суда РФ от 05.11.1998 г. "О применении судами законодательства при рассмотрении дел о расторжении барка", мол 3х летний срок считается только с того момента, когда супруга узнала о нарушении своих прав. Тут можно возразить: 1. Это касается совместной собственности, а вы уже распределили свои доли по 1/2. 2. Супруга чисто теоретически не могла не знать о существовании этого имущества )) и по сути ее права тут даже не могли теоретически даже нарушится.
В общем, бывает прокатывает, иногда приходится даже скриншоты отправлять через менеджеров. Нынче юристы/андеррайтеры банков не те, обмельчали и знания у них скудноваты.
Тут у Вас есть минус небольшой - автомобиль. Как Вы это все оформили в целом: купля-продажа доли и передача автомобиля. Просто тут можно рассмотреть тот факт, что наличие автомобиля и каких-либо денежных средств могли повлиять на итоговый раздел долей в квартире при разделе имущества.
Я б на месте юриста/андеррайтера Банка мог предположить, что Вы могли приобрести доли своей бывшей супруги на нажитые совместно с супругой деньги, да и в целом не вижу соглашения о разделе имущества.

"Поймите правильно, это был 2013 год, тогда не было как таковой судебной практики с подобными решениями. И к слову сказать, мне помогал хороший риэлтор. Следовательно тогда и требований ни у каких банков подобных не было."

Не совсем так. Институт брака и Семейный/Гражданский кодекс не вчера были созданы и написаны. Если вы на том этапе не до конца разобрались со своими вопросами, то вина в этом только ваша.
Как вариант предложите банку, что напишите нотариальное заявление, что не имеете супруги, которая могла бы претендовать на ваше имущество.

Максим,да я же не обвиняю Вас! Более того,поддерживаю,и сочувствую. Что делать? Ипотека в такой ситуации не ваш покупатель,значит искать того,кто купит и не станет заморачиваться с согласием бывшей,ведь и сроки исковой давности уже прошли,Росреестр сделку зарегистрирует. Ну и вариант договориться с ней,он по всей видимости не приемлем.

У Вас было по 1/2 доли. Потом вы выкупили долю у постороннего уже человека. Верно. Но Ваша старая доля была куплена в браке,вот банки и требуют согласие бывшей супруги.В идеале,,Вам нужно было при покупке доли у нее ,взять с нее сразу согласие на продажу квартиры,либо брачный договор,но тогда конечно об этом не подумали.Про паспортные столы. Они часто не соглашаются выписывать по доверенности,а некоторые выписывают без проблем.только просят,чтобы тот кто снимается с регучета,сам заполнил заявление о снятии. У меня такое было,выписывал по консульской доверенности человека.Можно было потребовать доверенному лицу письменный отказ паспортиста в выписке,может это подействовало бы ,а может и нет,и пришлось бы к руководству их идти ,и тратить время