Здравствуйте. В адресно-справочной информации (которая готовится подразделением МВД, запрос через Федеральный портал Госуслуг) полный бардак. Это касается и Москвы, и МО. В базе куча ошибок и несоответствий: отображается тот, кто не зарегистрирован, не отображается тот, кто зарегистрирован, часто в справку попадают люди из соседних домов/квартир. Ориентироваться на это в сделке не нужно. В Москве и МО нужно ориентироваться на документы жилищного учета: выписку из домовой книги (Москва - mos.ru; область - mosreg.ru). Если есть желание побороться в ветряными мельницами, можно ходить в МВД, просить внести изменения, у кого-то получается, у кого-то нет. Судебные прецеденты, в которых такие справки имели бы большую силу, чем выписки из домовых книг мне не известны. Во многих регионах ситуация другая, выписок из домовых книг нет, основной документ о прописанных - адресная справка, вот там именно на них и нужно ориентироваться.

Выписки из МФЦ имеют юридическую силу, но заказа одной выписки из МФЦ будет недостаточно для защиты покупателем своих прав в случае судебных разбирательств. Очень важно перепроверять информацию в МВД и прописывать в договоре купли-продажи заверения продавца по отсутствию прописанных лиц и что, покупатель полагается на такие заверения. Прописать ответственность продавца за предоставление недостоверной информации.

Чтобы честно ответить на ваш основной вопрос (имеют ли выписки мфц силу в суде) надо это суд пройти. Это первое. А второе, у нас такая судебная система... то, что один судья приобщит к материалам дела, другой откажет. Поэтому правильного ответа тут дать невозможно. В любом случае сведения отражающие регистрационный учет в жилом помещении в любом исполнении (МВД, МФЦ) должны быть у покупателя в виде документа и ссылкой по тексту договора приобретения права для целей подтверждения его добросовестности.