Добрый день. В решении этого вопроса поможет нотариус. Необходима доверенность и нотариально заверенная подпись на заявлении на регистрацию по месту жительства.
Однако, нередки случаи, когда даже при таком комплекте документов случается отказ. Существует мнение, что у сотрудников МВД есть негласное распоряжение, не производить регистрацию по месту жительства без личного присутствия правообладателя.
Про сайт гос.услуг знаете? Вместо двух визитов можно всё сделать за один. Причем займёт это не более 30 минут. Почитайте.

он без вас прописаться точно не сможет. а вы его прописать без его присутствия в принципе можете, но потребуются танцы с бубнами. в виде доверенности с его стороны во-первых, а во-вторых не каждый мфц пойдет на такое, но при определенной настойчивости их иногда получается убедить.

Или наоброт. Я мог бы его прописать без его присутствия....