Здравствуйте. Срок исковой давности понятие весьма условное. Три года это общий срок, но вот начало течения срока исковой давности... может наступить и через 5 и даже через 10 лет.
Настораживает? Проверяйте! И маму, и папу, и текущего собственника разумеется. Стоит или нет... покажет профессиональный анализ документов. Максимально обезопасить - правильно провести сделку, заручится необходимыми документами и "вишенкой на торте" сделать страхование титула с обязательным учетом ретроспективного покрытия.

Непонятно почему Вы не выяснили у продавцов по какой причине они оформляли через дарственную, а не через ДКП. Ведь налог при дарении близким родственникам не платится.
На Вашем месте я бы встретился с матерью и составил заявление в котором она собственноручно должна написать, что ей известно о продаже квартиры и она на неё не имеет никаких притязаний.
Плюс составить расписку о получении ей денег по ДКП и заверить её у нотариуса.
Если на контакт она не пойдёт, то я бы лучше отказался от такой сделки.

С уважением, эксперт по недвижимости Иванов Кирилл Анатольевич

"Так как срок исковой давности не вышел и первоначальная сделка может быть оспорена, т.к деньги фактически не передавались при продаже от матери к сыну, возможно есть расписка, но достояно ли этого, для того, что бы купить квартиру у сына новым покупателям." - что значит "достаточно"? достаточно для того чтобы полностью исключить риск? нет;
"Так же настораживает, что почему мать сразу не продала квартиру, а пришлось делать такую сложную схему, почему не договор дарения (скорее всего избегают налога)." - причин может быть масса. скорее всего, какие-то семейные терки (конфликты с другими родственниками и тд). налога при дарении от матери к сыну не возникает, они близкие родственники, поэтому версия с налоговой оптимизацией маловероятна;
"Подскажите, стоит ли входить в такую сделку, зная, что не прошло 3х лет по первому ДКП?" - зависит от вашей готовности рисковать. объяснение вам в любом случае будет предложено складное, вопрос в том, насколько оно будет соответствовать истине;
"Если да, то как максимально себя обезопасить при покупке квартиры от дальнейших притязаний." - максимально обезопасить = не связываться с мутными продавцами и объектами. доскональная проверка всех документов обязательна, но она не дает 100% безопасности. например, она не гарантирует от притязаний третьих лиц, хотя формально по документам все чисто: дкп, люди все на виду, и так далее...

Здравствуйте. Обратитесь к специалисту за сопровождением сделки.