В выписке из ЕГРН должна быть дата. Актуальность любой выписки полученной из ЕГРН = мгновению. Вам выдали выписку и в следующую минуту поступил запрос на регистрацию перехода права/обременения/ограничения.
При наличии ограничения продажа права без согласования этого вопроса с тем кем установлено ограничение недопустимо.
Вас или намеренно вводят в заблуждение или Вы чего-то не поняли или застройщик сам не знает о наличии ограничения права.
Информационно. На случай возникновения проблем для целей подтверждения своей добросовестности в суде любой покупатель должен предпринять комплекс разумных мер для того, чтобы убедиться в легитимности действий продавца. Одной из таких мер как раз является самостоятельный персонифицированный официальный запрос к реестру ЕГРН.
Так что не уповайте на добросовестность продавца и хорошо подумайте перед тем, как решиться на трату миллионов рублей / покупку недвижимости не имея полной объективной информации о нюансах данного рода мероприятия.

Это ненормально. Если квартира в залоге, то застройщик может продать только с согласия залогодержателя или погасить ипотеку и соотвественно погасить запить об ипотеке в Росреестре.

1.В выписке не указана дата. Не нормально. В ЕГРН всегда есть дата выдачи (и сведения которые в ней содержаться действительны именно на эту дату)
2. Откуда взялся залог? Странно. Застройщика часом не банкротят?
3. Закажите выписку ЕГРН самостоятельно (через МФЦ) там и будут самые актуальные сведения.
PS Возможен и вариант с недостоверностью онлайн базы (плохо их обновляют, очень много там мусора и устаревших сведений)